第三步是生成干酪根。在沉積時(shí)期，由于微生物的發(fā)酵活動，沉積的有機(jī)物中的蛋白質(zhì)、多糖等會被降解，大部分有機(jī)物會聚合成不溶于有機(jī)溶劑的有機(jī)物——干酪根，這是一種腐殖組分。干酪根是沉積有機(jī)質(zhì)的主體，約占總有機(jī)質(zhì)的80%~90%。小部分會生成瀝青，瀝青是大家非常熟悉的，柏油路都是用瀝青鋪的。

最后一步就是干酪根在特定溫度下生成石油（包括天然氣）。在地下不超過60℃的部位，干酪根生成石油極少。超過60℃，石油大量生成。低溫超過120℃時(shí)，低分子甲烷氣（即天然氣）大量產(chǎn)生。這其中經(jīng)歷了大量的催化裂化和熱裂化的化學(xué)反應(yīng)。

這樣一步一步，經(jīng)過幾百萬年，石油終于形成了。